Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms