Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms