Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HKR1P10072 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms