Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM228BP0C875 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM228BP0C875 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms