Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA5P08648 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms