Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERCC1P07992 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms