Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK1P06493 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms