Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYBBP04839 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYBBP04839 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms