Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGAP02671 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGAP02671 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGAP02671 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGAP02671 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGAP02671 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms