Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP6O75581 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LRP6O75581 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms