Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms