Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SPAG9O60271 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms