Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKNO60260 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKNO60260 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKNO60260 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKNO60260 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKNO60260 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKNO60260 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKNO60260 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKNO60260 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKNO60260 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms