Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLIN1O60240 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLIN1O60240 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms