Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DENRO43583 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DENRO43583 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DENRO43583 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DENRO43583 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DENRO43583 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DENRO43583 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENRO43583 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms