Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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