Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBDO15205 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBDO15205 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms