Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms