Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTDSP2O14595 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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