Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE40O14503 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms