Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms