Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA2E9PIF3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms