Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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