Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DXG7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DXG7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DXG7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DXG7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms