Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms