Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XIRP2A4UGR9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms