Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA6W5XKT8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms