Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms