Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TPRKBQ9Y3C4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms