Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD7AQ9UPZ6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms