Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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