Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms