Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK85

DKKL1, Dickkopf-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKKL1Q9UK85 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKKL1Q9UK85 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKKL1Q9UK85 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms