Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms