Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX4Q9UIU6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.5 ms