Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms