Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms