Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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