Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms