Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LMBRD1Q9NUN5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMBRD1Q9NUN5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMBRD1Q9NUN5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMBRD1Q9NUN5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms