Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM7SF3Q9NS93 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms