Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRN4Q9NRL3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRN4Q9NRL3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms