Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms