Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR12Q9C0I1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms