Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms