Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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