Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms