Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM55Q9BYV6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms