Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms