Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms